Amazing Grace conta a história de Shuu, um rapaz que acordou sem memórias em uma cidade coberta de neve. Com a ajuda dos moradores locais, ele passa a morar lá e estudar na St. Aria Academy. A vida seguia tranquila até um incidente no dia 25 de dezembro destruir quase toda a cidade.
Com a ajuda de Yune, ele volta no tempo para o dia 2 de dezembro para tentar evitar essa crise, porém nada do que eles façam muda o destino. Agora em um loop infinito, Shuu terá que entender os mistérios que rondam a cidade e porque apenas esses dias podem ser repetidos.
