Just a Chest conta a história de Issac, um baú de tesouro que ficou cansado de esperar na floresta e um dia descobriu ter a capacidade de se movimentar. Apesar da situação atípica de sua existência, ele logo se vê diante de um mundo no qual humanos e monstros estão em guerra e ele poderá escolher se aliar a um dos lados ou se esforçar para manter a neutralidade.
Entre os aliados que ele fará nessa jornada, temos o príncipe gentil Thursday, um rapaz que perdeu a memória há muito tempo e se apaixonou inexplicavelmente por Issac. Outro companheiro é Sapphi, um slime com forte senso de justiça que tenta ajudar todas as pequenas criaturas apesar de ser um tanto fraco fisicamente. Evy é uma gata a serviço do feiticeiro Calvin e, apesar de ter um impulso agressivo contra criaturas pequenas, ela consegue se manter amigável e controlar seus desejos.
O combate é baseado em turnos e há caminhos diferentes de história dependendo das decisões do jogador. Um detalhe curioso do jogo é sua mecânica de geração de tesouros que permite criar poções, dinheiro, equipamentos e outros elementos úteis coletando "Chest Power" ao lutar contra inimigos, ajudar pessoas em necessidade e até mesmo em conversas e exploração.
