Archetype Arcadia é uma visual novel pós-apocalíptica em que o jovem Rust e sua irmã Kristin entram em um jogo homônimo em realidade virtual em busca de uma cura para a "Original Syndrome" que afeta a garota. As pessoas que sofrem com essa doença sentem desejos incontroláveis, ilusões sensoriais e começam a ser afetadas com insanidade.
Uma pandemia desse distúrbio acabou com grande parte da humanidade e o jogo Archetype Arcadia provê um auxílio imediato para prolongar a vida de quem decide participar de seus desafios. Porém, lutas e reviravoltas sombrias também aguardam os personagens.