Chaos;Head Noah conta a história de um rapaz chamado Takumi Nishijo que é praticamente um hikikomori, mas tenta fingir que não. Com uma obsessão por anime, mangá, jogos e outros elementos da cultura pop japonesa, o rapaz vive cercado por figures de ação de belas garotas.
Porém, enquanto ele vive suas próprias ilusões, Shibuya sofre com um caso de crimes bastante misteriosos: a New Generation Madness. Esses assassinatos em massa são brutais e têm chamado a atenção da mídia. Um dia, um tal de Shogun compartilha imagens que parecem predizer o próximo assassinato. Takumi logo se vê diante de uma cena terrível de uma bela garota ensanguentada nas proximidades de uma nova vítima.
Fonte: Spike Chunsoft (press release)