Alternando entre áreas side-scroller e top-down, o jogo continua os eventos de Blaster Master Zero contando uma nova história de Jason e Eve. Depois de derrotarem a ameaça mutante no título anterior, eles se aventuram no espaço com o tanque de batalha "GAIA-SOPHIA". No entanto, Eve foi infectada por parasitas que estão lentamente corrompendo o seu corpo. Eles agora partem em busca do planeta natal da garota na esperança de encontrar uma cura.
Vale destacar também que tanto a versão do console da Nintendo quanto a do PC contarão com um DLC de Copen, deuteragonista da série Azure Striker Gunvolt. O personagem também estará disponível a partir do dia 29 de novembro.
Fonte: Inti Creates (Youtube)